1. Confutación de la delación hecha al Santo Tribunal de la Subida del alma a Dios, su autor el Padre fray José de Jesús María, carmelita descalzo... [Manuscrito]

2. Confutación de la delación hecha al Santo Tribunal de la Subida del alma a Dios, su autor el padre fray José de Jesús María, Carmelita Descalzo, impreso en Madrid en año de 1656 con algunos reparos sobre las proposiciones delatadas [Manuscrito]

3. Consulta hecha al señor Carlos II en 7 de diciembre de 1686 sobre los embarazos que causaba la Inquisición al Gobierno [Manuscrito]

4. Defensorio segundo en favor de la causa del Padre Francisco Monterón, religioso de la Reforma de San Nicolás de la orden de nuestro Padre San Francisco... [Manuscrito] : presentóse al santo y Supremo Consejo de la Santa Inquisición de España en mano del... Señor Don Diego de Arce y Reinoso, obispo Inquisidor General. Madrid, 15 de junio 1659

5. Delación y censura de las proposiciones de un libro intitulado Subida del alma a Dios, su autor fray José de Jesús María carmelita descalzo, impreso en Madrid en 1696 [Manuscrito]

6. Humilde súplica apologética que, por un libro titulado Subida de el alma a Dios..., prohibido por el Santo y Supremo Tribunal, hace a su Alteza el General y Procurador General de Carmelitas Descalzos, en nombre de toda su Congregación [Manuscrito]

7. Humilde súplica apologética, que por un libro intitulado Subida del alma a Dios, su autor fray José de Jesús María, prohibido por el Santo y Supremo Tribunal, hace a su Alteza el general y Procurador General de Carmelitas Descalzos, en nombre de toda la Congregación [Manuscrito]

8. Libro copiador de cartas relativas a informes de aspirantes a cargos inquisitoriales y otros asuntos del Tribunal de la Inquisición [Manuscrito]

9. [Licencia al Marqués de Mondéjar para tener y leer libros prohibidos]

10. Manual del Santo Oficio de la Inquisición [Manuscrito]

11. Manual práctico para inteligencia y prompto despacho de causas y expedientes que regularmente suelen ocurrir en el Santo Oficio de la Inquisición [Manuscrito]

12. Memorial que por parte de Su Majestad se dio a los teólogos, sobre las cosas de Paulo IV, año de 1555, y parecer del Reverendo Padre Maestro Fray Melchor Cano sobre el memorial antecedente

13. Notas al memorial que el Santo Oficio del Consejo Supremo dio, para calificar las obras y virtudes de Sor Luisa de la Ascensión, religiosa de Santa Clara de Carrión... y censura de los Padres Fray Pedro de Urbina y Fray José Vázquez, calificadores del Consejo, a la relación de la causa [Manuscrito]

14. Notas para las materias del Santo Oficio [Manuscrito]

15. Papeles borradores en defensa de la Madre Luisa de Carrión, según lo que se le consultó por el Tribunal de la Inquisición por los años de 1636 [Manuscrito]

16. Papeles de la Inquisición [Manuscrito]

17. Papeles varios

18. Recurso suplicatorio que el Procurador General de los Carmelitas Descalzos, en nombre de su religión, hace al Supremo y sacro Tribunal de la Fe..., sobre la proscripción de los dos tomos de la Subida del alma a Dios y entrada al paraíso espiritual, su autor el Padre fray José de Jesús María [Manuscrito]