981. Apología de la dedicatoria que puso al libro "Carta de guía de casados" [Manuscrito]

982. Apología de la religión católica [Manuscrito]

983. Apología del Instituto de los jesuitas [Manuscrito]

984. Apología del Padre Antonio Vieira [S.I.] [Manuscrito]

985. Apología del patronato de los reyes de España, relativo al derecho de presentar a las personas para ocupar los obispados [Manuscrito]

986. Apología en defensa de esta Monarquía de la Casa de Austria: [Manuscrito] para desengaño de los potentados de Europa y satisfación de los políticos de estos tiempos

987. Apología en defensa de la Monarquía y de la Casa de Austria, para desengaño de los potentados de Europa y satisfacción de los políticos de estos tiempos [Manuscrito]

988. Apología en excusación y favor de las fábricas del Reino de Nápoles [Manuscrito]

989. Apología en el pleito con la singular Compañía de Jesús, respondiendo a Pedro Avilés, su Provincial en esta Andalucía... [Manuscrito]

990. Apología erudita de sus obras y otros papeles [Manuscrito]

991. Apología mística en defensa de la contemplación [Manuscrito]

992. Apología mística en defensa de la contemplación divina, contra algunos maestros escolásticos que se oponen a ella [Manuscrito]

993. Apología mística y respuesta religiosa que presenta al supremo y sagrado Tribunal de la Santa Inquisición de España el general de la religión de los Carmelitas Descalzos, sobre... Subida del alma a Dios y entrada al paraíso espiritual, obra póstuma del padre José de Jesús María

994. Apologia Pater Gabrielis Vazquez e Sosietate Jesu pro jurisdictione ecclesiastica contra magistratus saeculares in duas partes divisa [Manuscrito]

995. Apología por la Historia de fray Gerundio de Campazas contra el papel intitulado Defensa del Barbadinho en obsequio de la verdad... [Manuscrito]

996. Apología por la historia de fray Gerundio: cartas de su autor al Penitente del P. Marquina

997. Apología por los ingleses insurgentes de la América [Manuscrito]

998. Apología por la Mística ciudad de Dios, de María de Jesús de Ágreda [Manuscrito]

999. Apología por sí y por su Madre, la universal Iglesia Católica [Manuscrito] : en el pleito contra la singular Compañía de Jesús, respondiendo a Pedro Avilés, su Provincial en esta Andalucía...

1000. Apología prima pro defensione Ecclesiae et Inmaculatae Conceptionis Beatae Mariae Virginis contra Bandelum et bandelizantes [Manuscrito]